Zhidaoと申します。
> で開くと、改行コードにあたる部分が黒い
> 四角の塗りつぶしの文字に置き換わっており、
改行コードがWinとUNIXとMacで異なるからですね。
「改行コード」でぐぐるといろいろ判るかも知れません。
テキストビューアorエディタがどれも受け容れてくれる賢いものであれば、
少なくとも読む段でこれらを気にする必要はないです。私はLinuxではless
and Emacsを(時代錯誤とか言われそうですが)、Winではxyzzyを使っています。
テキストファイルそのものを修正したい場合はnkf使ってみて下さい。
使い方はman nkfでどうぞ。
--
Zhidao