中村です。
ここでいうエイリアスとは、メールアドレスの別名の事で、
hogehoge@xxxxxへ来たメールをhoehoe@xxxxx(もしくは逆)
とみなす処理で、/etc/aliasesなどに設定します。
どちらに送っても、同じフォルダ(ユーザ)に届きます。
SMTPやMTAを一通り理解していないと、難解な問題に思えますが、
不思議な挙動ではありません。
phpのコードの問題というより、php.iniや、MTAの設定ですね。
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